科研情況簡介：

方雷，伟德官网手机版教授、博士生導師。自2015年回國工作以來，在伟德官网手机版從頭搭建了穩定高效的蛋白質組學和大數據平台，并逐步建立了多種疾病蛋白質組學研究的技術手段和方法，廣泛開展基于蛋白質組學的靶點鑒定和疾病發生機制研究。目前在Nature Aging，Nature Communications，EMBO Journal，Signal Transduction and Targeted Therapy，Redox Biology，CCS Chemistry以及蛋白質組學頂尖期刊Mol Cell Proteomics和J Proteome Res.共發表SCI論文70餘篇。作為主要完成人獲得了國家技術發明獎二等獎(排名第四，2012年度)、江蘇省科學技術獎一等獎(排名第三，2012年度)和華夏醫學科技獎三等獎（排名第三，2022年度）。主持國家自然科學基金面上項目三項和青年基金項目一項，主持江蘇省自然科學基金面上項目兩項，參與國家自然科學基金重點項目和軍隊後勤開放研究項目各一項。

研究方向：

1.蛋白質組學驅動的精準醫學：篩選和鑒定具有臨床診斷和治療靶點價值的疾病蛋白質标志物并進行轉化應用

2.化學蛋白質組學：藥物或代謝物小分子（如香葉基香葉基焦磷酸、法尼基焦磷酸、酮體和果糖等）靶點蛋白的鑒定及其調控代謝穩态和疾病發生的分子機制研究

3.蛋白質組學研究策略和方法的開發：包括蛋白質複合物的高效親和純化和鑒定（AP-MS和臨近标記技術）；蛋白質翻譯後修飾位點（PTMs：磷酸化、乙酰化、泛素化和異戊二烯化修飾等）的鑒定和生物學功能研究；利用蛋白質化學交聯技術研究特定蛋白複合物結合蛋白網絡的動态變化（QTAX）

科研與學術工作經曆：

   2022.01-至今，伟德官网手机版，教授

   2021.06-至今，伟德官网手机版，博士生導師

   2019.09-至今，南京大學化學與生物醫藥創新研究院，雙聘PI

   2015.03-2022.01，伟德官网手机版，副教授、碩士生導師

   2011.10-2015.02，美國紐約大學Langone醫學中心，助理研究員

   2007.03-2011.09，美國加州大學Irvine分校，博士後研究員

教育經曆：

   2001.09-2006.12，南京大學，生化與分子生物學，博士

   1997.09-2001.06，山東大學，生物學與生物技術，學士

教學情況簡介：

主持伟德官网手机版8年制和“5+3”本科生課程《細胞生物學》、科教融合課程《蛋白質組學驅動的腫瘤精準醫學》以及公選課《生物組學與人類疾病》，主持研究生課程《生物醫學儀器分析》等課程。

美國質譜學會會員、中國細胞生物學會會員

江蘇省細胞與發育生物學會理事

江蘇省高等學校醫藥教育研究會-醫學人文素質教育專業委員會理事（第四屆）

江蘇省抗癌協會腫瘤代謝專業委員會委員

江蘇省整合醫學研究會運動能量療愈專業委員會常務委員

STTT、Clinical and Translational Medicine和Journal of Proteome Research等期刊審稿專家

國家自然科學基金函審專家

(1) Xiaorui Chen, Yang Luo, Qing Zhu, Jingzi Zhang, Huan Huang, Yansheng Kan, Dian Li, Ming Xu, Shuohan Liu, Jianxiao Li, Jinmeng Pan, Li Zhang, Yan Guo, Binghao Wang, Guantong Qi, Zhen Zhou, Chen-Yu Zhang*, Lei Fang*, Yanbo Wang*, Xi Chen*. Small extracellular vesicles from young plasma reverse age-related functional declines by improving mitochondrial energy metabolism. Nature Aging. 2024 April 16. doi: 10.1038/s43587-024-00612-4.

(2) Characterization of protein lactylation in relation to cardiac metabolic reprogramming in neonatal mouse hearts. Zhang T, Zhu Y, Wang X, Chong D, Wang H, Bu D, Zhao M, Fang L*, Li C*. J Genet Genomics. 2024 Mar 11:S1673-8527(24)00055-9. doi: 10.1016/j.jgg.2024.02.009.

(3) Ketone bodies promote epididymal white adipose expansion to alleviate liver steatosis in response to a ketogenic diet. Zhao MF, Zhang XG, Tang YP, Zhu YX, Nie HY, Bu DD, Fang L*, Li CJ*. J Biol Chem. 2024 Jan 2:105617. doi: 10.1016/j.jbc.2023.105617.

(4) Li X, Wang N, Gui M, Wang C, Ding Y, Bai B, Li C, Zhang J, Fang L. Quantitative proteomics reveals PPAR signaling pathway regulates the cardiomyocyte activity of neonatal mouse heart. Proteomics.2023 Sep;23(18):e2200330. doi: 10.1002/pmic.202200330.

(5) Yan Wang^#, Jingzi Zhang^#, Jiafang Deng, Chengzhi Wang, Lei Fang*, Yan Zhang* and Jinbo Li*. Targeted Degradation of DNA/RNA Binding Proteins via Covalent Hydrophobic Tagging. CCS Chem. 2023, Just Accepted. DOI: 10.31635/ccschem.023.202302873.

(6) Wang B, Huang B, Li X, Guo Y, Qi G, Ding Y, Gao H, Zhang J, Wu X, Fang L. Development of functional anti-Gn nanobodies specific for SFTSV based on next generation sequencing and proteomics. Protein Sci. 2022 Nov;31(11):e4461.

(7) Ke  Lu, Si-Yu Shen, Ou-Yang Luo, Yue Lu, Tian-Shu Shi, Jing Wu, Qi Cheng,  Hua-Jian Teng, Di Chen, Xiang Lu, Chao-Jun Li, Qing Jiang, Lei Fang*,  Bin Xue*. Manipulating PP2Acα-ASK-JNK signaling to favor apoptotic over  necroptotic hepatocyte fate reduces the extent of necrosis and fibrosis  upon acute liver injury. Cell Death Dis. 2022 Nov 22;13(11):985.

(8) Wen-Yuan Wu, Zi-Xuan Wang, Tu-Shuai Li, Xiao-Qin Ding, Zhi-Hong Liu, Jie Yang, Lei Fang*, Ling-Dong Kong*. SSBP1 drives high fructose-induced glomerular podocyte ferroptosis via activating DNA-PK/p53 pathway. Redox Biology. 2022 Jun;52:102303.

(9) Yan Guo , Qi Li, Wei Ren, Hongyan Wu, Chengzhi Wang, Xinyu Li, Bin Xue, Yudong Qiu, Jingzi Zhang, Jun Chen, Lei Fang.  Quantitative Proteomics Reveals Down-Regulated  Glycolysis/Gluconeogenesis in the Large-Duct Type Intrahepatic  Cholangiocarcinoma. J Proteome Res. 2022 Oct 7;21(10):2504-2514.

(10) Jing Wu, He Liu, Haiquan Wang, Yuqi Wang, Qi Cheng, Ruochen Zhao, Hongliang Gao, Lei Fang*,  Feng Zhu*, Bin Xue*. iTRAQ-based quantitative proteomic analysis of the  liver regeneration termination phase after partial hepatectomy in mice.J Proteomics. 2022 Sep 15;267:104688.

(11) Cheng Q, Yuan X, Lin S, Zhao Y, Wang H, Zhu F, Wang Y, Xu T, Wu J, Wang K, Zhang J, Sun X, Li C, Liang H, Fang L*,  Xue B*. Serum proteome profiling reveals differentially expressed  proteins between subjects with metabolically healthy obesity and  nonalcoholic fatty liver disease. J Proteomics. 2022 May 30;260:104556.

(12) Lei Fang#*, Tu-Shuai Li#, Jing-Zi Zhang#,  Zhi-Hong Liu, Jie Yang, Bing-Hao Wang, Yu-Meng Wang, Jie Zhou,  Ling-Dong Kong*. Fructose drives mitochondrial metabolic reprogramming  in podocytes via Hmgcs2-stimulated fatty acid degradation. Signal Transduction and Targeted Therapy. 2021 Jul 9;6(1):253.

(13) Zhao R, Wang B, Guo Y, Zhang J, Chen D, He WM, Zhao YJ, Ding Y, Jin C, Li C, Zhao Y, Ren W, Fang L.Quantitative  Proteomics Reveals Arsenic Attenuates Stem-Loop Binding Protein  Stability via a Chaperone Complex Containing Heat Shock Proteins and  ERp44. Proteomics. 2021 Aug;21(16):e2100035.

(14) Lei Fang,  Danqi Chen, Jingzi Zhang, Hongjie Li, Beatrix Bradford, Chunyuan Jin.  Potential Functions of Histone H3.3 Lysine 56 Acetylation in Mammals. Epigenetics. 2021 May 24:1-20.

(15) Xiao  Jiang, Xinyi Wang, Xianming Ding,MengjieDu, Boran Li, Xialian Weng,  Jingzi Zhang, Lin Li, Rui Tian, Qi Zhu, She Chen, Liang Wang, Wei Liu, Lei Fang*, Dante Neculai*, Qiming Sun*. FAM134B oligomerization drives endoplasmic reticulum membrane scission for ER-phagy. EMBO J.2020 Mar 2;39(5):e102608.

(16) Yue Zhao, Meng-Fei Zhao, Shan Jiang, Jing Wu, Jia Liu, Xian-Wen Yuan, Di Shen, Jing-Zi Zhang, Nan Zhou, Jian He, Lei Fang*, Xi-Tai Sun*, Bin Xue*, Chao-Jun Li*. Liver governs adipose remodelling via extracellular vesicles in response to lipid overload. Nature Communications. 2020 Feb 5;11(1):719.

(17) Jingzi Zhang, Neng Tang, Yinjuan Zhao, Ruoyu Zhao, Xiao Fu, Dandan Zhao, Yue Zhao, Lan Huang, Chaojun Li, Yudong Qiu, Bin Xue, Lei Fang.  Global Phosphoproteomic Analysis Reveals Significant Metabolic  Reprogramming in the Termination of Liver Regeneration in Mice. J Proteome Res. 2020 Apr 3;19(4):1788-1799.

(18) Zhang J, Zhao R, Yu C, Bryant CLN, Wu K, Liu Z, Ding Y, Zhao Y, Xue B, Pan ZQ, Li C, Huang L, Fang L. IKK-mediated regulation of the COP9 signalosome via phosphorylation of CSN5. J Proteome Res. 2020 Mar 6;19(3):1119-1130.

(19) Cao Y, Ding W, Zhang J, Gao Q, Yang H, Cao W, Wang Z, Fang L*,  Du R*. Significant down-regulation of urea cycle generates clinically  relevant proteomic signature in hepatocellular carcinoma patients with  macrovascular invasion. J Proteome Res. 2019 May 3;18(5):2032-2044.

(20) Wu Y, Zhang J, Fang L*, Lee HC*, Zhao YJ*. A cytosolic chaperone complex controls folding and degradation of type III CD38. J Biol Chem. 2019 Mar 15;294(11):4247-4258.

* Co-corresponding author, ^# Co-first author

1.主持國家自然科學基金面上項目，32371366，2024/01-2027/12。

2.主持國家自然科學基金面上項目，32071256，2021/01-2024/12。

3.主持國家自然科學基金面上項目，31770838，2018/01-2021/12。

4.主持國家自然科學基金青年基金項目，31500664，2016/01-2018/12。

5.主持江蘇省自然科學基金面上項目，BK20221443，2022/07-2025/12。

6.主持江蘇省自然科學基金面上項目，BK20171338，2017/07-2020/06。

7.參與國家自然科學基金重點項目，31530046，2016/01-2020/12。

8.主持與南京諾唯贊生物科技有限公司技術開發橫向合作項目，“基于二代測序和蛋白質組學的基因工程抗體開發”，2018/01-2020/12。

9.主持與南京集思慧遠生物科技有限公司技術開發橫向合作項目兩項，“鄰近标記-定量蛋白質組學和化合物小分子靶點蛋白鑒定技術開發”，2022/11-2025/10；“農林業定量蛋白質組學技術開發”，2021/01-2022/12。

10.主持南京大學中央高校基本費教育部創新團隊項目、“雙一流”科技專項、技術創新基金重點項目、原創與交叉項目、國際合作交流項目和人才引進啟動基金項目等10餘項。

1．方雷（4/6），微生物基因工程可溶性表達及産物後加工新技術，中華人民共和國國務院，國家技術發明獎，二等獎，2013。

2．方雷（3/11），微生物基因工程可溶性表達及産物後加工新技術，江蘇省人民政府，江蘇省科學技術獎，一等獎，2012。

3．方雷（3/8），肝損傷再生修複關鍵機制與治療新策略，華夏醫學科技獎，三等獎，2022。

4．南京大學化學與生物藥物創新研究院（ChemBIC）2022年度雅辰管理創新獎

5．南京大學2022年度研究生招生先進個人